FreeDOS je začel svojo zgodovino dobivati po tem, ko je Microsoft objavil, da ne bo več ponuja MS-DOS kot lasten proizvod. Jim Hall, ki pa se s to odločitvijo Microsofta ni strinjal je nadaljeval razvoj DOS-a, ki je čez čas dobil ime FreeDOS. Tako je bila leta 1998 izdana prva inačica z oznako 0.05.
FreeDOS 1.1 tako prinaša podporo za USB kontrolerje in flash diske. Seveda pa to ni vse.
Več o samem projektu in prenos FreeDOS-a je na voljo tukaj.